Revenir à Les plate-formes

Plate-forme Séquençage Nouvelle Génération Moyen débit

Pierre RONCO responsable scientifique

Brigitte SURIN responsable technique 01 56 01 83 75    brigitte.surin@upmc.fr

 

Equipements :

Bioanaliseur 2100 Agilent

Le Bioanalyseur permet de mesurer la taille et de quantifier les ARN, ADN et protéines. Il nécessite une petite quantité (1µL) d’échantillon et donne des résultats fiables et rapides. Il est essentiel pour vérifier la qualité des librairies.

 

pf-genetique-3pf génétique 1

 

MiSeq illumina

Le Miseq permet de générer 25 millions de séquences maximum. Les lectures peuvent aller jusqu’à 600 nucléotides en paired-end (2X300), soit un maximum de 15 Gigabases lues. Il peut répondre à des besoins variés comme la capture de séquences cibles (design à façon), du « small genome » et « small RNA », du reséquençage, de la métagénomique et du séquençage d’amplicons.

 

Prestations :

  • Dosage (Qubit) et Vérification de la qualité des ADNs
  • Préparation des librairies
  • Passage sur Miseq et vérification de la qualité des runs
  • Rendu des données (les fichiers fastaq, vcf et bam) sur clef USB

 

Les images obtenues sont stockées sur disque dur externe sur la plateforme.